Le Premier Continent est en danger. Le président Tibérius, nouvellement réélu, a mis au point un plan lui permettant de voler les plus puissantes et dangereuses technologies de l'Agence. Quant à l'Agent Jean, il est victime d'un accident dans le laboratoire d'Henry et se retrouve rapetissé à l'échelle moléculaire. Par chance, il se lie d'amitié avec une espèce de nanorobots vivant dans les murs de l'édifice A... Ensemble, ils tenteront de contrecarrer les plans du président.