Près de trois siècles après la Chute, l'humanité a survécu, mais de nombreuses civilisations se sont effondrées. Un nouvel ordre a été instauré sous l'hégémonie de l'Église, grâce au pouvoir du cruciforme qui ressuscite ceux qui le portent. Sur Hypérion, Raul Endymion, qui a toujours refusé le cruciforme, est condamné à mort. C'est pourtant vivant qu'il se réveille, sauvé in extremis par Martin Silenus. Celui-ci a une mission pour lui : veiller sur sa nièce, Énée, la fille du cybride Keats et de l'humaine Brawne Lamia. Mais entre la jeune fille et son protecteur se tiennent trente mille hommes de la Pax, dont aux moins cinq mille gardes suisses, l'élite de l'élite. Car pour l'Église, Énée est une abomination...