Abe Sapien est, avec Hellboy, l'une des premières recrues du B.P.R.D. (Bureau de Défense et de Recherches sur le Paranormal). Les origines de cet humanoïde amphibien, découvert dans une chambre scellée sous les fondations d'un hôpital de Washington, remontent à la guerre de Sécession. Durant ses investigations pour le compte du B.P.R.D., Abe a découvert qu'il se nommait auparavant Langdon Everett Caul, scientifique et explorateur de l'occulte. Depuis quelque temps, il se met à agir en solitaire, s'éloignant des autres membres du B.P.R.D.Abe est accusé d'être à l'origine de l'extinction de la race humaine. Il rejoint la zone côtière, là où l'invasion des monstres a débuté et où un volcan a détruit la ville de Houston, chassant la grande majorité de la population. Il trouve refuge au sud du Texas, au sein d'un groupe d'adorateurs de la mort... Mais il n'est pas loin de perdre le peu qui lui reste...