Plusieurs décennies se sont écoulées depuis qu'Ultraman a sauvé la Terre de la dévastation. Les actes de bravoure de ce super-héros des temps passés sont désormais relégués aux livres d'histoire ou aux musées.Shinjirô est le fils de Shin Hayata, l'hôte du premier Ultraman. Grâce aux gènes d'Ultraman hérités de son père, il possède des capacités physiques hors du commun. Mais la soudaine attaque d'un ennemi inconnu va mettre un terme à la vie paisible de Shinjirô. Un implacable destin se met en route pour le jeune homme.Qu'arriverait-il si les extraterrestres n'avaient jamais réellement quitté notre planète et coopéraient avec le gouvernement ? Et si la paix n'était finalement qu'un feu de braises attendant que le vent de la guerre se remette à souffler ? Quand la menace ressurgit, l'humanité doit se trouver un nouveau sauveur, une nouvelle génération d'ULTRAMAN.